沅江市醫療保障局內設四個股室：辦公室、待遇保障和醫藥服務管理股、基金監管股、政策法規與行政審批股。職責分工如下：
一、辦公室。組織擬訂全市醫療保障工作規劃；負責機關 日常運轉，承擔文電、會務、機要、檔案、安全、保密、信息宣傳、扶貧和綜治等工作；負責機關財務、資產管理工作；綜合協調人大代表建議和政協委員提案辦理工作。
二、待遇保障和醫藥服務管理股。組織實施全市城鎮職工
和城鄉居民醫療保障籌資和待遇政策；組織實施全市醫療救助政 策；負責組織落實全市城鎮職工和城鄉居民基本醫療保險、生育 保險、大病保險、意外傷害保險、補充醫療保險、門診特殊病、 醫療救助、公務員醫療補助、離退休醫療保障等方面政策。負責指導全市健康扶貧有關工作；參與全市醫藥衛生體制改革工作。 統籌推進多層次醫療保障體系建設；建立健全醫療保障關系轉移接續制度；擬訂長期護理保險制度改革方案并組織實施。擬訂定點醫藥機構醫保協議和支付管理、異地就醫管理辦法和結算政策并組織實施；建立健全協議醫藥服務考核評價和動態準入退出機 制；組織推進醫保支付方式改革；組織開展藥品、醫用耗材、醫療技術的經濟性評價。
三、基金監管股。組織實施醫療保障基金監督管理辦法; 監督管理相關醫療保障基金，建立健全醫療保障基金安全防控機制，建立健全醫療保障信用評價體系和信息披露制度；負責對全 市定點醫藥機構執行醫療保險政策規定及服務協議等情況進行檢 查、稽核和協助考核；負責對醫保醫師（藥師）及參保人員遵守醫療保障法規、制度的情況進行稽核；負責接收醫保違規行為舉 報和投訴并轉交有關部門處理；負責省定醫保目錄和支付標準并 進行動態維護。指導和監督全市醫療保險、生育保險、醫療救助等醫療保障經辦工作；監督管理納入醫保支付范圍的醫療服務行 為和醫療費用，規范醫保經辦業務，依法查處醫療保障領域違法 違規行為。監督實施藥品、醫用耗材的招標采購、配送及結算管 理，指導監督招標采購平臺運行。監督管理藥品企業、醫療機構網上藥品、醫用耗材集中采購交易活動。
四、政策法規與行政審批股（醫藥價格、招標采購和人事 股）。負責組織開展醫療保障政策執行和基金運行重大問題的調查研究;負責組織起草地方性法規草案和標準，承擔規范性文件的 合法性審查工作，承擔行政復議、行政應訴的工作,負責信訪接待工作。負責醫療保障網上輿情監控。統籌協調“放管服”改革 和行政審批制度改革，牽頭負責“互聯網+政務服務” 一體化平臺建設、管理和使用，負責政務窗口的綜合管理，負責進駐政務窗口項目的受理、綜合協調督促辦理、結果回復。組織實施全市藥品、醫用耗材價格和醫療服務項目、醫療服務設施收費等政策， 建立價格信息監測和信息發布制度。負責組織實施醫藥價格改革；承擔政府定價藥品、醫用材料和有關制品、公立醫療機構醫療服務價格管理。承擔醫療機構價格等級評定工作。負責全市藥品、 耗材、器械招標采購、配送及結算工作；負責醫藥招標采購平臺 建設相關工作。負責機關和所屬單位紀檢、黨建、組織人事、機 構編制、績效、老干和工青婦等工作。